شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم از غشای پلاسمایی گیاه Kochia scoparia
نویسندگان
چکیده مقاله:
یکی از راهکارهای گیاهان برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرهای سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول میشود. ناقل‌های سدیم/هیدروژن غشای پلاسمایی (SOS1) یکی از بهترین پروتئین‌های درگیر در این فرآیند هستند. در این پژوهش از گیاه دولپه و شورزی Kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر همین اساس با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاهان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلئوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسیدآمینه‌ای از توالی کدکنندۀ این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباهت این توالی در سطح نوکلئوتیدی با حداکثر 84 درصد همولوژی و در سطح اسیدآمینه‌ای 92 درصد با استفاده از بررسی BLAST تأیید شد. تجزیه و تحلیلهای بعدی برای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباط آن با پروتئین‌های دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچهای آلفای آبگریز به عنوان قطعۀ گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنبالۀ با تعداد کمتر مارپیچهای آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعۀ داخل سلولی پروتئین می‌باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل‌های غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تأیید نمود.
منابع مشابه
شناسایی، جداسازی و توالی یابی ژن های آنتی-پورترna+/h+ غشاء واکوئلی در گیاه کوشیا (kochia scoparia)
یکی از استراتژی هایی که سلول های گیاهی برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی بکار می برند ذخیره سازی سدیم در درون واکوئل است، این ذخیره سازی، مانع از اثرات سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول می شود. که ناقل های درون سلولی سدیم/هیدروژن، یعنی پروتئین nhx بهترین پروتئین درگیر در این فرآیند می باشد. جداسازی سدیم در واکوئل از طریق عملکرد مبادله کننده na+/h+ تونوپلاست (nhx) و بوسیله شیب پروتون تولید شده توس...
ارزیابی بیان ژن آنتی پورتر /h+na+ غشای پلاسمایی گیاه aeluropus littoralis در شرایط تنش شوری و جداسازی و انتقال این ژن به گیاه توتون
شوری و به طور عمده کلرید سدیم، از رشد گیاهان جلوگیری نموده و سبب کاهش تولیدات کشاورزی می شود. در گیاهان عالی دفع یون سدیم از غشاء سلولی و هدایت و انتقال یون سدیم به واکوئل بواسطه آنتی پورترهای موجود در غشاهای پلاسمایی و واکوئلی انجام می شود. یکی از کارکردهای آنتی پورترسدیم/پروتون در غشای پلاسمایی دفع یون سدیم از سلول هاست. ژن salt overly sensitive 1 آنتی پورترسدیم/پروتون غشای پلاسمایی را کد می ...
15 صفحه اولNutritional and toxicological evaluations of kochia hay (Kochia scoparia) fed to lambs.
Kochia foliage that had tested positive to Dragendorff's reagent (presumptive alkaloids) and had elicited chronic toxicosis when fed to rats was fed to sheep to characterize early stages of kochia toxicosis and evaluate treatments that might improve tolerance. Twelve fine-wool lambs (46 +/- 9 kg BW) were fed chopped kochia hay (35%) mixed with chopped alfalfa hay (65%) for 4 wk. The kochia diet...
متن کاملFitness Outcomes Related to Glyphosate Resistance in Kochia (Kochia scoparia): What Life History Stage to Examine?
A fast-spreading weed, kochia (Kochia scoparia), has developed resistance to the widely-used herbicide, glyphosate. Understanding the relationship between the occurrence of glyphosate resistance caused by multiple EPSPS gene copies and kochia fitness may suggest a more effective way of controlling kochia. A study was conducted to assess fitness cost of glyphosate resistance compared to suscepti...
متن کاملEffects of metoclopramide on steers fed Kochia scoparia hay.
Kochia hay that had elicited mild toxicosis in sheep and cattle when fed for 21 d was fed to young, growing steers to evaluate the efficacy of metoclopramide for preventing kochia toxicosis. Twelve steers (271 +/- 39 kg) were given ad libitum access to Kochia hay for 38 d. Six steers were dosed orally with 15 mg of metoclopramide/kg of BW three times each week in gelatin capsules, and six steer...
متن کاملشناسایی و جداسازی ژن رمز کننده na+/h+ آنتی پورتر واکئولی از گیاه هالوفیت aeluropus littoralis
به منظور جداسازی ژن رمز کننده na+/h+ آنتی پورتر واکوئلی از گیاه هالوفیتaeluropus littoralis، rnaی کل از ریشه، ساقه و برگ گیاه استخراج و از روی آن cdnas ساخته شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی برای ژن مورد نظر ازcdnasی تهیه شده از rnaی ریشه، ناحیه رمزشونده ژن رمز کننده ی na+/h+ آنتی پورتر واکوئلی(alnhx2) توسط تکنیک race جداسازی شد. قطعه جدا شده 1538 جفت باز بوده و شامل یک چهارچوب خوانش باز (or...
منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 5 شماره 2
صفحات 113- 122
تاریخ انتشار 2017-01
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023